Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSDE1O75534 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSDE1O75534 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms