Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAK2O60296 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAK2O60296 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms