Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
SYNJ1O43426 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SYNJ1O43426 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms