Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 ILF3-223ENST00000593061 475 ntTSL 314.64□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 25
RBFOX2O43251 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.655e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 ILF3-222ENST00000592763 3866 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -15e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.471e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.081e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.81□□□□□ -1.161e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 25
RBFOX2O43251 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.291e-6■■■■□ 25
RBFOX2O43251 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 25
RBFOX2O43251 SIN3B-208ENST00000596638 1104 ntTSL 57.15□□□□□ -1.261e-6■■■■□ 25
RBFOX2O43251 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.138e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.018e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 SMAD7-202ENST00000545051 2211 ntTSL 211.94□□□□□ -0.58e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.748e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 SMAD7-206ENST00000588190 401 ntTSL 510.38□□□□□ -0.758e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 SMAD7-203ENST00000585986 563 ntTSL 410.29□□□□□ -0.768e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 SMAD7-204ENST00000586093 574 ntTSL 210.03□□□□□ -0.88e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 SMAD7-205ENST00000587336 549 ntTSL 49.29□□□□□ -0.928e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 RPTOR-208ENST00000574767 2461 ntTSL 213.15□□□□□ -0.36e-8■■■■□ 25
RBFOX2O43251 RPTOR-211ENST00000577161 3633 ntTSL 29.32□□□□□ -0.926e-8■■■■□ 25
RBFOX2O43251 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.323e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.733e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 GSDMD-208ENST00000528475 2067 ntTSL 219.44■□□□□ 0.72e-10■■■■□ 25
RBFOX2O43251 GSDMD-211ENST00000531184 2213 ntTSL 217.63■□□□□ 0.412e-10■■■■□ 25
RBFOX2O43251 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-10■■■■□ 25
RBFOX2O43251 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-10■■■■□ 25
RBFOX2O43251 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.032e-10■■■■□ 25
RBFOX2O43251 GSDMD-202ENST00000524846 3462 ntTSL 212.86□□□□□ -0.352e-10■■■■□ 25
RBFOX2O43251 GSDMD-215ENST00000534018 1101 ntTSL 512.44□□□□□ -0.422e-10■■■■□ 25
RBFOX2O43251 LAMA5-202ENST00000370677 1674 ntTSL 216.16■□□□□ 0.185e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 NINL-206ENST00000489780 630 ntTSL 314.48□□□□□ -0.095e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 RABGAP1-202ENST00000373647 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.154e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 RABGAP1-205ENST00000456584 3897 ntTSL 23.75□□□□□ -1.814e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.42e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 CHN2-203ENST00000409350 539 ntTSL 411.14□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 CHN2-213ENST00000439384 578 ntTSL 510.23□□□□□ -0.772e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 CHN2-205ENST00000409964 547 ntTSL 48.25□□□□□ -1.092e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 CHN2-220ENST00000474070 754 ntTSL 56.49□□□□□ -1.372e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.492e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 TSC2-216ENST00000497886 3248 ntTSL 211.3□□□□□ -0.66e-7■■■■□ 25
RBFOX2O43251 MIB2-215ENST00000502470 780 ntTSL 520.69■□□□□ 0.95e-9■■■■□ 25
RBFOX2O43251 MIB2-225ENST00000510793 889 ntTSL 516.81■□□□□ 0.285e-9■■■■□ 25
RBFOX2O43251 GAA-204ENST00000570803 956 ntTSL 514.99□□□□□ -0.012e-9■■■■□ 25
RBFOX2O43251 OGFR-203ENST00000450048 553 ntTSL 38.15□□□□□ -1.11e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 GID8-201ENST00000266069 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.111e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 MIB2-212ENST00000486072 568 ntTSL 316.56■□□□□ 0.249e-9■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 AAMP-210ENST00000494720 1134 ntTSL 216.09■□□□□ 0.174e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 AAMP-207ENST00000465442 1016 ntTSL 215.78■□□□□ 0.124e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 AAMP-208ENST00000475678 2270 ntTSL 213.99□□□□□ -0.174e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 AAMP-209ENST00000489767 1833 ntTSL 513.45□□□□□ -0.264e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.364e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.474e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.574e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 AAMP-203ENST00000422731 742 ntTSL 310.32□□□□□ -0.764e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.452e-9■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.472e-9■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.52e-9■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.522e-9■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 PFN2-204ENST00000460404 942 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.554e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 PFN2-207ENST00000468323 894 ntTSL 28.77□□□□□ -1.014e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.07□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.773e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 319.85■□□□□ 0.773e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 SMS-203ENST00000457085 931 ntTSL 519.69■□□□□ 0.743e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 ASRGL1-209ENST00000534183 1177 ntTSL 1 (best)19.17■□□□□ 0.663e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.553e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.523e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.433e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.192e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-214ENST00000530132 542 ntTSL 415.91■□□□□ 0.142e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-221ENST00000533713 560 ntTSL 415.73■□□□□ 0.112e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-218ENST00000533532 584 ntTSL 215.73■□□□□ 0.112e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-213ENST00000529701 573 ntTSL 515.73■□□□□ 0.112e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-224ENST00000534582 556 ntTSL 515.73■□□□□ 0.112e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-208ENST00000526330 582 ntTSL 315.73■□□□□ 0.112e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-209ENST00000527702 579 ntTSL 415.73■□□□□ 0.112e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-220ENST00000533618 574 ntTSL 415.73■□□□□ 0.112e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-223ENST00000534001 585 ntTSL 415.73■□□□□ 0.112e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-217ENST00000533195 560 ntTSL 415.73■□□□□ 0.112e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 SNHG12-201ENST00000461448 1629 ntTSL 1 (best)15.7■□□□□ 0.13e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-219ENST00000533616 2041 ntTSL 215.58■□□□□ 0.092e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 215.33■□□□□ 0.043e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.013e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-216ENST00000532456 664 ntTSL 414.65□□□□□ -0.062e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 SNHG12-206ENST00000474814 1903 ntTSL 214.53□□□□□ -0.083e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.13e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 SNHG12-203ENST00000464115 712 ntTSL 313.93□□□□□ -0.183e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 SNHG12-208ENST00000481220 751 ntTSL 313.93□□□□□ -0.183e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 DNMT1-215ENST00000588913 1775 ntTSL 513.81□□□□□ -0.28e-9■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 UGGT1-202ENST00000376723 6682 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.273e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 213.24□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.333e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 PIK3C2A-203ENST00000531428 1593 ntTSL 1 (best)12.94□□□□□ -0.343e-7■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 APLP2-225ENST00000534761 551 ntTSL 512.75□□□□□ -0.372e-13■■■■□ 24.9
RBFOX2O43251 PIK3C2A-204ENST00000532035 584 ntTSL 312.41□□□□□ -0.423e-7■■■■□ 24.9
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