Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBDO15205 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBDO15205 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBDO15205 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBDO15205 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBDO15205 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBDO15205 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBDO15205 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBDO15205 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBDO15205 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBDO15205 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms