Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFAP73A6NFT4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CFAP73A6NFT4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms