Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQJ8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms