Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HDGFL3Q9Y3E1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms