Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UTP11Q9Y3A2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UTP11Q9Y3A2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms