Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS51Q9UID3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS51Q9UID3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms