Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTNNA3Q9UI47 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms