Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCF2Q9UG63 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCF2Q9UG63 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms