Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMPD4Q9NXE4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMPD4Q9NXE4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms