Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOMER3Q9NSC5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms