Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms