Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BIN3Q9NQY0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms