Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IL1RAPQ9NPH3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL1RAPQ9NPH3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL1RAPQ9NPH3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL1RAPQ9NPH3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL1RAPQ9NPH3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL1RAPQ9NPH3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL1RAPQ9NPH3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL1RAPQ9NPH3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL1RAPQ9NPH3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL1RAPQ9NPH3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL1RAPQ9NPH3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL1RAPQ9NPH3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms