Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms