Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MCOLN1Q9GZU1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms