Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPS2Q9BXY5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPS2Q9BXY5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms