Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ERVK-6Q9BXR3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms