Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MCMBPQ9BTE3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms