Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HERPUD2Q9BSE4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HERPUD2Q9BSE4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms