Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM79Q9BSE2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM79Q9BSE2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms