Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF559Q9BR84 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms