Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3GL2Q99962 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3GL2Q99962 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms