Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms