Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC38A3Q99624 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC38A3Q99624 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms