Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHDQ96IW2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms