Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFRP2Q96HF1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFRP2Q96HF1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFRP2Q96HF1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFRP2Q96HF1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFRP2Q96HF1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFRP2Q96HF1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFRP2Q96HF1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms