Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CPNE2Q96FN4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms