Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM12Q96EX1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM12Q96EX1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms