Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMIGD2Q96BF3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms