Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUBCNQ92622 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUBCNQ92622 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms