Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMPDL3AQ92484 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPDL3AQ92484 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms