Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf54Q8WWF1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1orf54Q8WWF1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms