Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYRIPQ8NFW9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYRIPQ8NFW9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms