Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA4Q8NEY3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA4Q8NEY3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms