Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BBOF1Q8ND07 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms