Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM229BQ8NBD8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms