Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HACE1Q8IYU2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACE1Q8IYU2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms