Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCIMPQ6UWF3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCIMPQ6UWF3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms