Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 SLC35F5-212ENST00000498768 1711 ntTSL 1 (best)17.5■□□□□ 0.399e-12■■■■■ 41.5
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PRPF8Q6P2Q9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.832e-9■■■■■ 41.4
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PRPF8Q6P2Q9 TRIM37-209ENST00000582852 501 ntTSL 21.8□□□□□ -2.126e-7■■■■■ 41.4
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PRPF8Q6P2Q9 ZMYM2-201ENST00000382870 3456 ntTSL 1 (best)1.56□□□□□ -2.162e-6■■■■■ 41.3
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PRPF8Q6P2Q9 UGGT1-205ENST00000438277 3113 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 41.3
PRPF8Q6P2Q9 EEF1A1-206ENST00000488500 792 ntTSL 25.68□□□□□ -1.57e-15■■■■■ 41.3
PRPF8Q6P2Q9 YTHDC1-204ENST00000506175 581 ntTSL 35.66□□□□□ -1.54e-11■■■■■ 41.3
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PRPF8Q6P2Q9 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 41.3
PRPF8Q6P2Q9 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 41.3
PRPF8Q6P2Q9 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.261e-10■■■■■ 41.3
PRPF8Q6P2Q9 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.371e-10■■■■■ 41.3
PRPF8Q6P2Q9 RBM17-207ENST00000465906 914 ntTSL 24.47□□□□□ -1.691e-11■■■■■ 41.3
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PRPF8Q6P2Q9 TNFAIP3-205ENST00000485192 604 ntTSL 24.77□□□□□ -1.651e-8■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 TNPO1-214ENST00000605210 752 ntTSL 20.93□□□□□ -2.265e-7■■■■■ 41.2
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PRPF8Q6P2Q9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.216e-8■■■■■ 41.2
PRPF8Q6P2Q9 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.626e-8■■■■■ 41.2
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 679.7 ms