Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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SGCAQ16586 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCAQ16586 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SGCAQ16586 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SGCAQ16586 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SGCAQ16586 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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SGCAQ16586 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SGCAQ16586 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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SGCAQ16586 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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SGCAQ16586 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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SGCAQ16586 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCAQ16586 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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