Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NUDT21-204ENST00000566340 581 ntTSL 35.71□□□□□ -1.52e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 NUDT21-206ENST00000568822 385 ntTSL 55.27□□□□□ -1.572e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 MAP4K4-215ENST00000489490 362 ntTSL 34.75□□□□□ -1.652e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.82e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.822e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.822e-7■■□□□ 12.4
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PUM1Q14671 GTF2E2-203ENST00000518599 737 ntTSL 55.46□□□□□ -1.542e-9■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 GTF2E2-202ENST00000518445 426 ntTSL 53.05□□□□□ -1.922e-9■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.557e-9■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 NOP53-207ENST00000598681 1358 ntTSL 522.09■■□□□ 1.137e-9■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 NOP53-212ENST00000600410 4185 ntTSL 215.8■□□□□ 0.127e-9■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.212e-7■■□□□ 12.4
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PUM1Q14671 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 POLE-205ENST00000503265 1501 ntTSL 419.59■□□□□ 0.732e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 ZNF598-201ENST00000561787 786 ntTSL 318.4■□□□□ 0.542e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 ZNF598-209ENST00000567625 775 ntTSL 517.2■□□□□ 0.342e-7■■□□□ 12.4
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PUM1Q14671 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.332e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.325e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPP1R18-204ENST00000488324 1328 ntTSL 315.31■□□□□ 0.042e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.85□□□□□ -0.032e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPP1R18-203ENST00000467662 1156 ntTSL 312.8□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 PPP6R2-205ENST00000401672 2199 ntTSL 212.77□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 ZNF24-205ENST00000590140 756 ntTSL 312.75□□□□□ -0.372e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 VASP-207ENST00000588482 804 ntTSL 512.57□□□□□ -0.44e-6■■□□□ 12.4
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PUM1Q14671 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.512e-7■■□□□ 12.4
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PUM1Q14671 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.635e-7■■□□□ 12.4
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PUM1Q14671 NUSAP1-213ENST00000560898 708 ntTSL 39.55□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 12.4
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PUM1Q14671 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.422e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.542e-7■■□□□ 12.4
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PUM1Q14671 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.828e-7■■□□□ 12.4
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PUM1Q14671 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.317e-7■■□□□ 12.4
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PUM1Q14671 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.458e-10■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 GRK2-203ENST00000524899 751 ntTSL 316.36■□□□□ 0.217e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.353e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.293e-7■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.33e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 SSRP1-202ENST00000293880 6296 ntTSL 215.9■□□□□ 0.148e-8■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 SSRP1-201ENST00000278412 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.668e-8■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 ALDOC-208ENST00000582381 571 ntTSL 213.6□□□□□ -0.231e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 CAPRIN2-205ENST00000454014 4398 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.581e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 CAPRIN2-201ENST00000298892 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.651e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 ALDOC-206ENST00000578590 839 ntTSL 410.75□□□□□ -0.691e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 CAPRIN2-207ENST00000537108 2187 ntTSL 58.65□□□□□ -1.021e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 CAPRIN2-208ENST00000537553 6543 ntTSL 26.81□□□□□ -1.321e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 CAPRIN2-204ENST00000433722 3012 ntTSL 1 (best)6.69□□□□□ -1.341e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 CAPRIN2-216ENST00000548676 3221 ntTSL 1 (best)6.22□□□□□ -1.411e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.451e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.491e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 CAPRIN2-217ENST00000553026 1097 ntTSL 25.25□□□□□ -1.571e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 CAPRIN2-209ENST00000538387 882 ntTSL 35.01□□□□□ -1.611e-6■■□□□ 12.4
PUM1Q14671 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.259e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 CTCFL-202ENST00000371196 3491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.659e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 CTCFL-201ENST00000243914 3567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.759e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 CTCFL-207ENST00000429804 3864 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.769e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 CTCFL-216ENST00000608263 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.869e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 CTCFL-222ENST00000609232 3668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.959e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.11e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 EIF3G-208ENST00000589454 873 ntTSL 511.87□□□□□ -0.511e-6■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 ARID4B-206ENST00000444620 1660 ntTSL 58.7□□□□□ -1.024e-9■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 RNF168-202ENST00000437070 2202 ntTSL 216.94■□□□□ 0.34e-7■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.054e-7■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.932e-11■■□□□ 12.3
PUM1Q14671 PAIP2-207ENST00000511381 365 ntTSL 518.07■□□□□ 0.482e-11■■□□□ 12.3
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