Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LSAMPQ13449 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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