Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
XRCC4Q13426 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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