Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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