Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EGR3Q06889 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms