Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CAV1Q03135 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAV1Q03135 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAV1Q03135 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAV1Q03135 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAV1Q03135 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAV1Q03135 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAV1Q03135 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAV1Q03135 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAV1Q03135 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAV1Q03135 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAV1Q03135 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAV1Q03135 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAV1Q03135 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAV1Q03135 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAV1Q03135 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAV1Q03135 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAV1Q03135 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAV1Q03135 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAV1Q03135 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAV1Q03135 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAV1Q03135 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAV1Q03135 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAV1Q03135 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms